根敦嘉措（1475-1542），1475年出世在后藏達納地區的岳噶多吉丹，十歲時，以班欽·隆日嘉措為先的扎什倫布寺經師們商討后，評定他為根敦珠巴的轉世投胎，被迎請到扎什倫布寺，之后被追覺得第二世達賴喇嘛。十二歲時，他在班欽·隆日嘉措身后接納了近事戒，起名字根敦嘉措貝桑布。當初冬天水陸法會期內，在扎什倫布寺遁入空門。他依次依止班欽·隆日嘉措、班欽·益希孜摩等上師學習培訓《釋量論》以及他諸部大論，還跟益希孜摩聽受了很多灌頂、教誡等。
1494年，根敦嘉措前去哲蚌寺學經，追隨嘉央列巴曲覺聽受《入中論》、《現觀莊嚴論》、《密宗道次第廣論》等顯密教學。20歲時在哲蚌寺受比丘戒。根敦嘉措27歲時，完成了《文殊菩薩名號經注釋》。自此，他到后藏的達納，追隨上師貢噶堅贊聽受了很多教誡、佛咒；隨后又趕到前藏，在熱振、甘丹、左右密院等處講經傳法。
1509年秋天，根敦嘉措在塔波地域的加查宗拉姆拉措湖濱建造了群科杰梅朵塘寺，建造了大經堂內的佛象佛殿，并在此處開設了大施食水陸法會。這期內他從班欽·索朗則摩學了從宗喀巴大師承傳出來的六臂怙主的除障法、《時輪根本續廣疏》、《十三尊怙主教教》、《勝樂根本續廣釋》、《呼金剛廣釋》及其《宗喀巴師徒三人全集》、《遍知一切根敦珠巴全集》等。之后，群科杰寺和拉姆拉措湖被評定為格魯派的勝地。西藏自治區僧俗很多人覺得將來的事兒可以在湖泊中展現出來，因此晚輩達賴喇嘛過世后探尋轉世投胎“靈童”時，西藏自治區僧俗頂層通常派人到這兒看來拉姆拉措湖內的呈現狀況。1510年，扎什倫布寺頂層迎請根敦嘉措上任扎寺的第五任法臺。在任的六年時間里，他將扎寺正殿改建為82根柱頭，準時完工了40間僧舍。在夏天和冬天水陸法會期內，他每日向眾多眾僧授課《釋量論》、《俱舍論》、《般若十萬頌》、《密續注疏》等諸多顯密經論。1517年，因哲蚌寺堪布的強烈推薦和哲蚌寺全體人員眾僧的要求，根敦嘉措被帕珠政黨委派為哲蚌寺第十任堪布。從今以后，他每一年冬、春天住在哲蚌寺，夏秋季兩個季節住在群科杰寺。
據《黃琉璃》記述，1530年根敦嘉措在帕珠政黨的支助下，在哲蚌寺南角建造了甘丹頗章宮。之后三、四、五世達賴喇嘛都定居在這兒，直至五世達賴改建西藏布達拉宮后，達賴喇嘛的居所才遷往西藏布達拉宮。
1526年，根敦嘉措被委派為色拉寺堪布。1542年，根敦嘉措在哲蚌寺坐化，壽終67歲。根敦嘉措坐化之后，哲蚌寺的頂層喇嘛剛開始宣布找尋他的轉世靈童。1544年評定了堆龍地區的一個皇室子女為他的轉世投胎，并于1546年把這個年僅4歲的小孩迎請到哲蚌寺，使他接任根敦嘉措的法位，稱他為活佛。這一小孩便是第三世達賴喇嘛索朗嘉措。這件事情能夠說成格魯派選用活佛轉世規章制度的開始。
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