真言以長度來分，一位本尊便有大咒、中咒和小咒三種真言。大咒又稱之為壓根陀羅尼、壓根咒與大心咒，是將諸尊本地內證、本誓、福報作詳盡宣說的陀羅尼；中咒又稱之為心真言、心密秘咒、心咒，是本尊內證密秘的精義，也就是壓根陀羅尼的心要真言；小咒又稱之為隨心所欲真言、心中心咒，是本尊壓根陀羅尼關鍵。除此之外也有一字咒的叫法，指的是將本尊的種子字做為真言持誦，或是在種子字以前再加歸命句子而成的真言。
真言以內容和實際意義來分，還可以分成三種。第一種是徹底由無意義的文學語言構成的真言，一些是原本的實際意義早就消退，一些則是從一開始就沒有一切實際意義；第二種是混和無意義和更有意義的文學語言構成的真言；第三種是由更有意義的文學語言構成的真言。由無意義的文學語言構成的真言關鍵常見于雜密經典，絕大多數是去除病癥與障難等的咒文。
此外，真言以秘語者的類型來分，可如而言、觀音菩薩金鋼說、二乘說、萬界說、地居天說五種，前三種為圣者真言，后二種為眾神真言；以密教三絕大多數來分，可分成佛部、蓮華部、金鋼部三部真言；以修法特性來分，可分成息災法、增益值法、尊敬法、調伏法四種真言。
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